Zakład Rachunkowości Zarządczej powołany został do życia mocą Zarządzenia Rektora SGH z dnia 16. maja 2001 r. Początkowo była to jednostka organizacyjna Katedry Rachunkowości. Od dnia 2. lutego 2015 r. Zakład jest jednostką Instytutu Rachunkowści przy Kolegium Zarządzania i Finansów.
Pierwszym Kierownikiem Zakładu Rachunkowości Zarządczej, aż do końca roku akademickiego 2011/2012 była prof. dr hab. Anna Karmańska. Od 1. października 2012 r. funkcję tą pełnił dr Rafał Grabowski.
Aktualnie (od 1.10.2017 r.) kierownikiem Zakładu Rachunkowości Zarządczej jest dr Magdalena Giedroyć.